Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGMATQ9BSE5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms