Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERPUD2Q9BSE4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms