Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GINS3Q9BRX5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms