Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEC22CQ9BRL7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms