Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms