Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP1Q96S65 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP1Q96S65 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms