Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CICQ96RK0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms