Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A9Q96Q91 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms