Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms