Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
ALS2Q96Q42 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms