Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF48Q96MX3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms