Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM20AQ96MK3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms