Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNBD2Q96M20 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms