Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms