Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms