Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HHIPL1Q96JK4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms