Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRT1Q96EB6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms