Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms