Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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FAM3DQ96BQ1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3DQ96BQ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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