Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTPBP3Q969Y2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTPBP3Q969Y2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms