Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRUQ92729 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRUQ92729 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms