Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms