Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms