Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC7Q8WUI4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC7Q8WUI4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms