Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms