Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CSNK2A3Q8NEV1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CSNK2A3Q8NEV1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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CSNK2A3Q8NEV1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CSNK2A3Q8NEV1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CSNK2A3Q8NEV1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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CSNK2A3Q8NEV1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A3Q8NEV1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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