Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC191Q8NCU4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC191Q8NCU4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms