Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMB4Q86W47 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMB4Q86W47 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMB4Q86W47 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNMB4Q86W47 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNMB4Q86W47 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms