Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms