Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC80Q76M96 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC80Q76M96 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms