Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP34Q70CQ2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP34Q70CQ2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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