Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms