Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms