Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf135Q5VTT2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms