Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms