Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR44Q5JSH3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR44Q5JSH3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR44Q5JSH3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR44Q5JSH3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR44Q5JSH3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
WDR44Q5JSH3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
WDR44Q5JSH3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms