Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PITRM1Q5JRX3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITRM1Q5JRX3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms