Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN4Q5BKX8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms