Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL39P5Q59GN2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL39P5Q59GN2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms