Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COBLL1Q53SF7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms