Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BOLA3Q53S33 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms