Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms