Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LETM2Q2VYF4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETM2Q2VYF4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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