Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPHKAPQ2M3C7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPHKAPQ2M3C7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPHKAPQ2M3C7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPHKAPQ2M3C7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPHKAPQ2M3C7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPHKAPQ2M3C7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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