Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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