Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6V1FQ16864 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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