Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPP1Q16831 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms