Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CRY1Q16526 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRY1Q16526 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms