Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNXAQ16473 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms