Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CNGA3Q16281 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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CNGA3Q16281 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CNGA3Q16281 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CNGA3Q16281 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CNGA3Q16281 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CNGA3Q16281 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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CNGA3Q16281 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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CNGA3Q16281 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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